菌肥是微生物肥料的俗称，它是一种带活菌体的辅助性肥料。土壤中存在着大量的微生物(包括细菌、真菌、放线菌)，一般每克土含有几亿至几十亿个微生物。有些对作物生长发育有益，有些则有害。人们用科学的方法从土壤中分离、选育有益微生物，经过培养、繁殖、制成菌剂，将这些菌剂应用于农业，使作物增产，称为菌肥。目前我国生产和应用的菌肥主要有根瘤菌、固氮菌、磷细菌、钾细菌、EM菌肥料等。菌肥是通过有益微生物的生命活动，拮抗有害微生物，促进土壤中养分的转化，提高土壤养分的有效性，改善作物营养条件，增加土壤肥力。

       菌肥的作用有一下几方面：

       1、改善土壤养分供应状况

　　菌肥主要通过各种菌剂促进土壤中难溶性养分的溶解、释放。菌剂在代谢过程中释放出大量的无机有机酸性物质，促进土壤中微量元素硅、铝、铁、镁、钼等的释放及螯合，有效打破土壤板结，促进团粒结构的形成，使被土壤固定的无效肥料转化成有效肥料，改善了土壤中养分的供应情况、通气状况及疏松程度。

       2、促进作物生长

       菌肥的使用，促进了刺激素的产生，调节、促进作物的生长发育。菌剂的使用，可以促进赤霉素、生长素和其他活性物质的产生。

       3、增强作物抗病抗逆能力

       菌肥中部分菌种具有分泌抗菌素和多种活性酶的功能，杀死致病真菌和细菌；大量的田间试验证明，菌肥的应用可以降低病虫害发生率及增强作物的抗逆性能。如对棉花黄枯萎病，稻瘟病，小麦的白粉病、茎腐病，蔬菜猝倒病、立枯病、青枯病等有一定的防治和控制作用，大量实验表明地恩地微生物菌剂可有效某些种类线虫病的发生。菌肥还有明显的抗旱、耐寒、抗倒伏、抗盐碱的效果，增强作物的抗病性，从而有效预防作物生理性病害的发生。